同济大学苏州研究院是由同济大学和苏州市吴中区合作成立的科研院所，研究院依托同济大学强大的科学研究和自主创新能力，主要开展技术转化、新产品开发、技术咨询和人才培养等方面的工作。研究院目前拥有两个研究中心—“生物医药研发中心”和“污水控制工程技术研究中心”。

同济大学特派从海外引进的领军人物房健民教授和戴晓虎教授分别负责两个中心的工作。生物医药研究中心的研发重点主要包含：人源化单克隆抗体新药、基因工程重组蛋白质新药、靶向治疗药物和干细胞治疗的临床应用。污染控制工程技术研究中心的研究方向包括：工业废水处理新技术研发、污水处理升级改造及回用新技术、城市有机质废物资源化利用新技术、污染控制低碳及碳足迹技术研究。