西安市妙应堂医药有限公司前身是未央区妙应堂药店,从1983年10月开办以来,至今已有二十六年的历史，“妙应堂”的名称是企业的创始人杨海林总经理以药王孙思邈的字号“妙应真人”的“妙应”来为自己的店命名，“妙应堂”店名已经过商标注册，并被命名为西安市著名商标，成为企业的识别标志，无形资产。
近几年来，妙应堂发展态势迅猛。从2003年开始直到2009年底，已经扩展到10家门店，总营业面积3000多平米，经营品种上万种，员工达300多人，除了久负盛名的未央区三桥妙应堂大药房，还有高陵县妙应堂龙凤园药店、莲湖区自强西路妙应堂大药房、莲湖区龙首北路妙应堂大药房、莲湖区永新路妙应堂大药房、未央区二十八街妙应堂大药房、未央区六村堡妙应堂大药房、未央区相家巷妙应堂大药房、浐灞新区浐灞金街妙应堂大药房、莲湖区自强东路向荣小区妙应堂大药房，10家门店目前都以单店形式存在，由总部集中管理，收支独立、成本分开，形成互相竞争、互相学习的十店合一，一分为十的管理形态。允许各店搞特色经营，结合本店地处的地理位置和人文环境，搞宣传、做活动、提高经营业绩。
2008年4月申请成立公司，10家门店有7家属于公司性质，另外三家还保留个体门店。
西安市妙应堂医药有限公司总部设立于三桥妙应堂大药房二楼，总经理杨海林为企业负责人、公司法人，下设运营副总一名，财务总监一名，行政总监一名，部门设置有业务采供部（包含公司配送中心）、财务部、质量管理部、行政人事部、网络信息部、企划部、外务部、新店扩展部，各部门在总经理的领导下，在运营副总的直接管理下，为10家门店提供强有力的后勤支持。
西安市妙应堂医药有限公司始终坚持“以质量求生存 以诚信求发展 以服务为根本”的企业发展策略，坚持严格的GSP规范管理，10店的硬件设施全部按GSP规范设置。目前有8家门店都已经通过GSP认证和复查。公司设有专门的质量管理机构，负责人员的专业培训和质量管理工作，员工大部分都具有中专以上的学历，都经过省市药监部门的培训，做到持证上岗。
妙应堂医药企业特别热心于社会公益事业，经常组织员工去三桥敬老院看望老人，免费为他们测量血压和做各种身体检查并送去价格不菲的常用药品。妙应堂医药企业还经常为希望工程、灾区群众捐款捐物，在今年的汶川地震中，妙应堂在未央区首先倡导捐款捐物，和未央区工商局、个协共同在三桥妙应堂大药房店门口公开募捐，其中妙应堂的员工就捐款7000余元，得到了区民政局和区政府及省市领导的关注和赞扬，并为总经理杨海林颁发了“抗震救灾先进个人”的奖牌，除此以外，公司还先后获得“省级文明工商户”、“市级光彩之星”、“市级诚信药店”、“市级文明工商户”，尤其是在2008年12月，获得了“全国百名文明诚信个体工商户”的荣誉，在人民大会堂受到了吴仪副总经理等国家领导人的接见，回来以后未央区政府、区文明办还特意在未央区政府礼堂为此专门召开表彰大会，此为未央区自成区以来次为个人召开这样的表彰会，这也是全体妙应堂员工的荣誉。
妙应堂医药企业的领头人杨海林经理，他以一种新的高度，新的视角来观察审视整个药品零售企业，根据自己的企业特点，他决定在今年继续拓展企业的发展空间，对现有门店的规模进行扩充，对其余门店采取灵活的管理方法，采取公司内部公开招标的形式招聘人才，以优厚的待遇进行奖励，以提升门店销售额，开办新店，让企业完成小规模到大规模，形成区域垄断的局面，加强管理，扩展营业范围，由单体药店向连锁化、公司化、集团化逐渐过度。

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